中外合作办学是上海交通大学的悠久传统。为了更好地利用国外优质教育资源，借鉴其先进的教学和管理经验，上海交通大学积极探索合作培养拔尖创新人才之路，努力与海外名校资源共享，优势互补，并创造条件让学生获得海外优质教育资源，培养具有国际视野的创新型人才。
学校充分发挥学院（系）作为国际化发展主体的积极性，大力支持和资助学院（系）与世界一流大学合作，积极探索多方位深层次的国际化合作办学实践，在引入国际优质教育资源上取得了丰硕的成果。近年来学校进一步优化中外合作办学模式、合作学科的多元化发展，创办出了一批富有成效和示范效应的中外合作办学项目。截至目前，学校现共拥有经教育部批准的4所中外合作办学机构和8个中外合作办学项目：
中外合作办学机构
上海交通大学中欧国际工商学院
上海交通大学密西根学院
上海交通大学巴黎卓越工程师学院
上海交通大学国际农业与生态学院
中外合作办学项目
上海交通大学与加拿大不列颠哥伦比亚大学合作举办国际工商管理硕士学位教育项目
2002年上海交通大学与加拿大不列颠哥伦比亚大学尚德商学院共同合作，开设国际工商管理硕士（IMBA）课程，不列颠哥伦比亚大学名列世界大学排名前30，其尚德商学院在北美商学院中名列前茅，项目颁发外方管理学硕士学位，每年招生规模为50人。
https://imba.sjtu.edu.cn/
上海交通大学与加拿大渥太华大学合作举办临床医学专业本科教育项目
2015年上海交通大学医学院与渥太华大学医学院合作举办的临床医学本科项目获教育部批准，项目学制5年，每年计划内招收规模为60人，项目对接上海市综合教育改革的重大战略，完善适应国际化背景的现代卓越医学创新人才教育模式，构建中外医学教育合作办学的新模式。
https://www.shsmu.edu.cn/osjsm_cn/index.htm
上海交通大学与法国KEDGE商学院（原马赛商学院）合作举办工商管理硕士学位教育项目
2003年上海交通大学与法国马赛商学院合作开设工商管理硕士（MBA）课程，法国KEDGE商学院成立于1872年，也是法国十大精英商学院之一，项目颁发外方管理学硕士学位，每年招生规模为50人。
https://icci.sjtu.edu.cn/program/index/kedge/151
上海交通大学与俄罗斯莫斯科航空学院合作举办航空航天工程硕士研究生教育项目
交大-莫航项目于2019年获教育部批准为中外合作办学项目，旨在为我国及“一带一路”沿线国家培养具有国际视野、厚基础、重实践的航空航天领域未来精英，采用双学位培养模式和国际化教学体系，每年计划内招生规模40人，学制2.5年，中俄学生同班授课，符合要求的毕业学生颁发交大和莫航双硕士学位。
https://www.aero.sjtu.edu.cn/
上海交通大学与新加坡国立大学合作举办数量金融硕士学位教育项目
2018年与新加坡国立大学合作举办，集中两所高校在量化金融、金融数学、统计学、数据科学等方向最顶尖的学术力量和师资力量，旨在培养具有国际化视野、全面掌握数量金融理论基础、通晓金融实务运作的高级复合型专业人才。项目发放外方数量金融硕士学位，每年自主招生规模为30人。
https://math.sjtu.edu.cn/nus/
上海交通大学与新加坡南洋理工大学合作举办高级管理人员工商管理硕士学位教育项目
2002年上海交通大学与新加坡南洋理工大学商学院合作开设高级管理人员工商管理硕士（EMBA）课程，颁发外方管理学硕士学位，每年自主招生规模为50人。全球移动课堂是课程的一大特色，办学课程多元化、国际化、独树一帜而又严谨创新。
https://www.acem.sjtu.edu.cn/intl/cooperation.html
上海交通大学与英国曼彻斯特大学合作举办管理学博士学位教育项目
2012年由上海交通大学和英国曼彻斯特大学商学院合作举办，项目旨在培养兼具卓越领导力和科研精神的高层次国际化管理人才，每期招生规模为25人，颁发外方工商管理博士学位证书（招生有效期已于2018年截止）。
https://www.acem.sjtu.edu.cn/intl/cooperation.html
上海交通大学与法国斯特拉斯堡大学合作举办医学教育专业博士研究生教育项目
本项目2013年9月获教育部批准，为国内首个医学博士中外合作办学项目，每年计划内招生计划为30人，学制为8年，项目借鉴法国先进的教学理念和教学模式，大胆实践和创新，旨在培养基础知识广博、临床能力扎实，具备国际化视野和科研能力的复合性人才。
https://www.shsmu.edu.cn/cfmsf/hzxm1/lcyxfybxm.htm